Пиперът се напада от много болести. В зависимост от причинителите те се разделят на три основни групи – гъбни и бактерийни и вирусни. Условията на отглеждане са определящи за развитието на една или друга болест.
Сиво гниене
Сивото гниене /Botrytisе cinerea/ по пипера e едно от най-често срещаните заболявания, предимно при оранжерийно отглеждане на пипер и предизвиква сериозни икономически щети. Болестта се развива върху листата, стъблата и плодовете. Появяват се воднисти петна, които бързо се разрастват и обхващат цялото растение. Характерно е образуването на сив плесенов налеп по всички заразени части.
Тъй като гъбите живеят върху растителните отпадъци като сапрофит, конидии има навсякъде и могат да инфектират растенията щом възникнат благоприятни условия за това. За развитие на заразата е необходима относителна влажност от 85%. Температурата няма съществено значение, защото заразата се развива в широк температурен интервал – 0-35 градуса.
Болестта се пренася чрез семената под формата на мицел или склероции.
Защита
Поради това, че паразитът присъства навсякъде, нужно е прецизиране и придържане към агротехническите мерки, задължително изхвърляне на растителните отпадъци, дезинфекция и контрол на относителната влажност /при оранжерийно отглеждане/.
Химическите мерки предвиждат: третиране с Пролектус 50 ВГ – 8-120 г/дка с работен разтвор 50-150 л/дка (карантинен срок 1 ден).
Брашнеста мана
Причинителят на брашнестата мана по пипера е гъбичката Leveillula taurica. Тя образува спори, които са много устойчиви на неблагоприятните условия на околната среда. Гъбата паразитира върху спонтанната флора през цялата година и спорите се разнасят от въздушните течения. На горната част на листата се появяват дребни, светли петна с неправилна форма, а върху опаковата им страна се образува фин бял налеп. Листата пожълтяват, свиват се и изсъхват.
За контрол на брашнестата мана се предвиждат общи фитосанитарни мерки.
При висока степен на нападение растенията се третират с Топаз 100 ЕК, Шавит 25 ЕК, Байфидан 250 ЕК.
Люцернова мозайка
Люцерновата мозайка се причинява от вирус – Alfalfa mosaic virus. Характеризира се с голям брой и различна големина жълтеникави петна по листата, които по-често са деформирани. Плодовете също са деформирани и докато са зелени,върху тях се виждат жълтеникави линии и е позната като „жълта шарка“. Голяма част от цветовете остават стерилни“. Вирусът се пренася чрез семената.
Защита
Основна мярка в борбата е унищожаване на плевелите в насажденията и наоколо , защото вирусите се намират в тях и инсектите, главно листни въшки, трипсове и цикади, които смучат сокове от растенията ги пренасят. Не трябва да се отглежда пипер в близост до люцерна.
Химическите мерки предвиждат борба с инсектите и пръскане с Протеус, Калипсо или Конфидор.
Столбур (Stolbur phitoplazma)
Столбурът е вирусно заболяване, което се пренася от цикади. Най-често се среща в градини, които се намират в близост до изоставени затревени площи. Болните растения се отличават с хлоротичен или силно жълт цвят и завити ладиообразно листа. Цветовете остават стерилни, а образувалите се вече плодове са дребни, тънки и безвкусни.
Защита
Борбата е насочена срещу цикадите. В началните периоди могат да се използват препарати с по-дълъг карантинен срок: Би-58, Вазтак идр. На по-късните етапи се пръска с: Калипсо, Актара и др. с по-къс карантинен срок.
Бактерийно струпясване
Hanthomonas vericatoria е бактерия, която причинява болестта. На гърба на листата се образуват тъмнозелени петна, които с времето се разрастват и изсветляват. Листата се деформират, пожълтяват и опадат.„
Защита
Използват се агротехнически мерки и обеззаразяване на почвата.
От химическите препарати се използват медни, но те не лекуват заразата, а само я забавят
