Болестите не подминават и къпината. Много често те предизвикват предивременен листопад, забавят нарастването на леторастите, прореждат и състаряват насажденията, намалява добива и качеството на плодовете. Най-голямо значение при къпината имат гъбните болести.
Силно заразените издънки се изрязват Една от най-разпространените болести както по културната, така и по дивата къпина е антракноза. Засяга листата, листните дръжки, издънките и плодовете. По листата петната са много дребни, закръглени, сиви, с широк пурпурен венец. По стъблата се образуват дълбоки язви. Нападнатата тъкан вкоренява и се напуква. Болестта се причинява от гъбата Elsimoe veneta. Зимува във вид на мицел по нападнатите стъбла и окапалите листа. Разсейването и заразяването става при наличие дъжд или роса. Във всички райони, където се отглежда къпината, сортът Бойсен проявява много висока чувствителност (фиг. 17). С неприятната болест може да се справим като се използва здрав посадъчен материал. Силно заразените издънки се изрязват. Редовете се поддържат чисти от плевели. В райони с чести превалявания растенията трябва да се пръскат с един от следните препарати - дитан М-45 (2 %), купроцин (-,4 %), пероцин (0,25 %), около средата и края на май.
Необходимо е проветряване на редовете Септериозата/листните петна/ е друга често срещана болест по къпината. Тя напада и поразява листата и издънките. По листата се наблюдават закръглени петна, които първоначално са бледо кафяви, а по-късно избледняват в средата и центърът им опада. По издънките първоначално се образуват светли петна, върху които по-късно се появяват плодни тела и повредената тъкан се разкъсва. Те са основен източник за разпространяване на болестта. При благоприятни за нея условия - по-ниски температури и чести превалявания тя може да предизвика предивременна деформация, намаляване на количеството и качеството на добива и общо отслабване на растенията. За да се предпазят насажденията от болестта трябва да се осигурява по-добро проветряване на редовете. Срещу болестта са ефикасни медсъдържащите фунгициди, както и заместителите им.
