Язовир Пчелина е в лош екологичен потенциал, с влошени качества по макрофити и фитопланктон съобщават от пресцентъра на ИАРА. Водата в язовира е с трайни отклонения по следните показатели – БПК5, електропроводимост, съдържание на разтворен кислород/ наситеност с кислород, амониев азот, нитритен азот, нитратен азот, общ азот, общ фосфор, ортофосфати. В РИОСВ Перник и в Басейнова дирекция „Западнобеломорски район“ през годините са постъпвали многобройни сигнали свързани с качеството на водите или за измряла риба. Ниската естествената самопречиствателна способност на язовира, както и допълнителния антропогенен натиск са причина да не бъде постигната целта за добър екологичен потенциал и добро химично състояние. Към настоящия момент в ИАРА не са постъпвали научно-обосновани данни за състоянието на рибните популации в язовир Пчелина. В тази връзка, Изпълнителна агенция по рибарство и аквакултури призовава заинтересованите лица да не предприемат действия по зарибяване на горепосочения язовир, докато не бъде постигнато добро екологично и химично състояние.
Съгласно Наредба 37 от 10 ноември 2008 г. за ползването на язовирите - държавна собственост, в рибностопанско отношение и правилата за извършване на стопански, любителски риболов и аквакултури в обектите - държавна собственост по чл. 3, ал. 1 от Закона за рибарството и аквакултурите, разселване на риба и/или други водни организми в рибностопанските обекти по чл. 3, ал. 1, т. 1 и 2 ЗРА се извършва по реда на глава четвърта от същата наредба. Зарибяването се извършва след уведомяване на съответното териториално звено на ИАРА и в присъствието на комисия, в която задължително се включват: инспектор от териториалното звено на ИАРА, ветеринарен лекар - служител на Българската агенция по безопасност на храните (БАБХ), представител на собственика на обекта, представител на ползвателя на обекта в случай че има такива. При промяна в гореспоменатите обстоятелства, същите ще бъдат публикувани на сайта на ИАРА.
