За контрол на чесновата муха се прилагат системни мерки

За да няма голяма плътност на чесновата муха, чесънът не трябва да се отглежда на една и съща площ или близо до площ, на която е отглеждана същата култура предната година. Торенето с оборски тор е недопустимо, защото мухите силно се привличат от него. За унищожаване на какавидите е добре освободената от чесъна площ да бъде дълбоко изорана. За сеитба трябва да се използва само здрав и качествен посадъчен материал. При прибирането се унищожават силно нападнатите растения и растителните остатъци.

[B%]Химичен контрол[%B]
Първото пръскане срещу чесновата муха се прави в началото на летежа, а останалите - с интервал от 7 до 10 дни, като по принцип пръсканията не трябва да са повече от три. Регистрирани продукти за растителна защита срещу този неприятел няма. Могат да се използват контактни инсектициди срещу възрастното насекомо, преди яйцеснасяне. Борбата с чесновата муха трябва да приключи 15-20 дни преди прибиране на продукцията, като се спазва карантинния срок на приложените инсектициди. Чесънът, предназначен за зелена консумация, може да се третира еднократно, при установен летеж на мухата, когато растенията са още малки и не са готови за консумация. Препоръчително е при това пръскане да се използват пиретроидни инсектициди с кратък карантинен срок, който задължително трябва да се спазва.